[ Source: lumpy-sv ]
Package: lumpy-sv (0.3.1+dfsg-5)
Links for lumpy-sv
Debian Resources:
Download Source Package lumpy-sv:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Generel sandsynlighedsramme for strukturel variantregistrering
LUMPY, en lille SV-registreringsramme, der naturligt integrerer flere SV-signaler på tværs af flere prøver. LUMPY har forbedret sensitivitet, specielt når SV-signalet er reduceret til enten data med lav dækning eller lav intra-prøve variant allel frekvens.
Other Packages Related to lumpy-sv
|
|
|
|
-
- dep: bamkit
- Værktøjer for fælles BAM-filmanipulationer
-
- dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)
- Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)
- Tilbyd funktionalitet for zlib C-bibliotek i en C++-iostrøm
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- GNU Standard C++ bibliotek v3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-pysam
- Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
-
- dep: samblaster
- Markerer dubletter, udtrækker discordant/split-læsninger
-
- dep: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- rec: sambamba
- Værktøjer for arbejde med SAM/BAM-data
Download lumpy-sv
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 181.5 kB | 631.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 159.7 kB | 563.0 kB | [list of files] |
| armel | 153.3 kB | 545.0 kB | [list of files] |
| armhf | 161.4 kB | 433.0 kB | [list of files] |
| i386 | 198.4 kB | 673.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 167.4 kB | 720.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 175.8 kB | 708.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 183.2 kB | 803.0 kB | [list of files] |