Package: qiime (2020.11.1-1)
Links for qiime
Debian Resources:
Download Source Package qiime:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Liubov Chuprikova (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [qiime2.org]
Similar packages:
Kvantitativ indsigt i mikrobiel økologi
QIIME 2 er en funktionsrig og decentraliseret mikrobiome analysepakke med fokus på data og analysegennemsigtighed. QIME 2 gør det muligt for forskere at starte en analyse med rå DNA-sekvensdata og afslutte med figurer og statistiske resultater i udgivelseskvalitet. Nøglefunktioner:
* Integreret og automatisk registrering af dataherkomst * Semantisk typesystem * Udvidelsesmodulsystem for udvidelse af mikrobiome analysefunktionalitet * Understøttelse for flere typer af brugerflader (f.eks. API, kommandolinjen, grafisk)
QIIME 2 er et fuldstændigt nyt design og omskrivning af QIIME 1 mikrobiome analysedatakanalen. QIIME 2 vil adressere mange af begrænsningerne i QIIME 1, men de funktioner der gør QIIME 1 til en funktionsrig og bredt anvendt analysedatakanal bevares.
QIIME 2 understøtter i øjeblikket en oprindelig start til slut-mikrobiome analysedatakanal. Ny funktionalitet vil blive tilgængelig via QIIME 2-udvidelsesmoduler. Du kan se en liste over tilgængelige udvidelsesmoduler på QIIME 2's side over udvidelsesmoduler. »future«-siden viser udvidelsesmoduler under udvikling.
Other Packages Related to qiime
|
|
|
|
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-bibtexparser
- Python 3 library to parse bibtex files
-
- dep: python3-dateutil
- Funktionsrige udvidelser til Python 3's standardmodul datetime
-
- dep: python3-decorator
- forenkl brug af Pythondekoratører med programmører
-
- dep: python3-networkx
- Værktøj til at oprette, manipulere og studere komplekse netværk - Python 3
-
- dep: python3-pandas
- Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
-
- dep: python3-pyparsing
- Alternativ til at oprette og køre simple grammatikker - Python 3.x
-
- dep: python3-tzlocal
- Tzinfo-objekt for den lokale tidszone
-
- dep: python3-yaml
- YAML-fortolker og udleder for Python 3
-
- rec: q2-cutadapt
- QIIME 2-udvidelsesmodul til arbejdet med adaptere i sekvensdata
-
- rec: q2-demux
- QIIME 2-udvidelsesmodul for demultiplexing af sekvenslæsninger
-
- rec: q2-feature-classifier
- QIIME 2-udvidelsesmodul der understøtter taksonomisk klassifikation
-
- rec: q2-feature-table
- QIIME 2-udvidelsesmodul der understøtter operationer på funktionstabeller
-
- rec: q2-metadata
- QIIME 2-udvidelsesmodul for arbejdet med og visualisering af metadata
-
- rec: q2-quality-filter
- QIIME 2-udvidelsesmodul for PHRED-baseret filtrering og tilpasning
-
- rec: q2-types
- QIIME 2-udvidelsesmodul der definerer typer for mikrobiom analyse
-
- rec: q2cli
- Klikbaseret kommandolinjegrænseflade for QIIME 2
-
- rec: q2templates
- Designskabelonpakke for QIIME 2-udvidelsesmoduler
Download qiime
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 147.0 kB | 1,057.0 kB | [list of files] |