[ Source: snap-aligner ]
Package: snap-aligner (1.0.0+dfsg-2 and others)
Links for snap-aligner
Debian Resources:
Download Source Package snap-aligner:
- [snap-aligner_1.0.0+dfsg-2.dsc]
- [snap-aligner_1.0.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [snap-aligner_1.0.0+dfsg-2.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Pranav Ballaney (QA Page)
External Resources:
- Homepage [snap.cs.berkeley.edu]
Similar packages:
Scalable Nucleotide Alignment Program
SNAP er en ny sekvenssammenligner, som er 3-20 gange hurtigere og lige så præcis som eksisterende værktøjer såsom BWA-mem, Bowtie2 og Novoalign. Programmer kan afvikles på gængse x86-processorer og understøtter en rig fejlmodel, som gør at den billigt kan matche læsninger med flere forskelle fra referencen end andre værktøjer. Dette giver SNAP op til 2 gange lavere fejlrate end eksisterende værktøjer (i nogle tilfælde) og lader dig matche større mutationer, som de måske mangler. SNAP læser også BAM, FASTQ eller gzippet FASTQ og skriver SAM eller BAM, med indbygget sortering, dublet markering og BAM-indeks.
Other Packages Related to snap-aligner
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download snap-aligner
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| ppc64el | 1.0.0+dfsg-2+b1 | 770.8 kB | 2,176.0 kB | [list of files] |