Package: qcumber (2.3.0-2)

Links for qcumber

Debian Resources:

Download Source Package qcumber:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [gitlab.com]

Similar packages:

Kvalitetskontrol af genomsekvenser

QCPipeline er et værktøj til kvalitetskontrol. Arbejdsforløbet er som i det følgende:

 1. Kvalitetskontrol med FastQC
 2. Ryd op i læsninger med Trimmomatic
 3. Kvalitetskontrol af læsningerne med FastQC
 4. Oversæt læsninger mod reference via bowtie2
 5. Klassificer læsninger med Kraken

Other Packages Related to qcumber

depends

recommends

suggests

enhances

dep: debconf (>= 0.5)

Debian konfigurationshåndteringssystem

or debconf-2.0

virtual package provided by cdebconf, cdebconf-udeb, debconf
dep: libjs-angularjs

lets you write client-side web applications as if you had a smarter browser
dep: libjs-bootstrap

HTML, CSS og JS-ramme
dep: libjs-d3

JavaScript visualization library for HTML and SVG
dep: libjs-jquery

JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: python3-biopython

Python 3-bibliotek for bioinformatik
dep: python3-jinja2

Lille men hurtigt og letanvendelig enkeltstående skabelon-generator
dep: python3-matplotlib

Pythonbaseret plotsystem i en stil svarende til Matlab - Python 3
dep: r-base-core

GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
dep: r-bioc-savr

GNU R - fortolk og analyser Illumina SAV-filer
dep: r-cran-ggplot2

Implementering af Grammar of Graphics
dep: r-cran-quantreg

GNU R-pakke for quantile-regression
dep: snakemake

Pythonisk system for håndtering af arbejdsforløb

Download qcumber

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	49.3 kB	236.0 kB	[list of files]