all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: porechop  ]

Package: porechop (0.2.4+dfsg-2)

Links for porechop

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package porechop:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Adaptertrimmer for Oxford Nanopore-læsninger

Porechop er et værktøj til at finde og fjerne adaptere fra Oxford Nanopore-læsninger. Adaptere i slutningen af læsninger trimmes væk, og når en læsning har en adapter i midten opfattes det som kimærisk og skæres op i separate læsninger. Porechop udfører omhyggelige sammenligninger for effektivt at finde adaptere, selv ved lav sekvensidentitet. Porechop understøtter også demultiplexing af Nanopore-læsninger, der fik stregkode med Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit eller Rapid Barcoding Kit.

Other Packages Related to porechop

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download porechop

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 53.7 kB233.0 kB [list of files]
arm64 51.9 kB225.0 kB [list of files]
armel 50.1 kB220.0 kB [list of files]
armhf 50.3 kB204.0 kB [list of files]
i386 55.1 kB232.0 kB [list of files]
mips64el 52.3 kB229.0 kB [list of files]
mipsel 51.9 kB227.0 kB [list of files]
ppc64el 56.3 kB293.0 kB [list of files]
s390x 52.5 kB233.0 kB [list of files]