Package: msxpertsuite (5.8.9-1)

Programpakke til massespektrometri - metapakke

msXpertSuite tilbyder programmer til at modelopbygge lineær (bio-) polymer kemi, simulere massespektrale data, analyse og data-mine masse. Det er efterfølgeren til GNU plyXmass, først, og så massXpert.

Programmerne massXpert og mineXpert gør følgende muligt:

massXpert:

 - lav helt nye kemidefinitioner for polymerer
 - brug definitionerne til at udføre nemme beregninger som i en
   lommeregner fra skrivebordet
 - udfør sofistikeret sekvensredigering og simuleringer for polymerer
 - udfør m/z-listesammenligninger

Kemiske simuleringer omfatter spaltning (enten kemisk eller enzymatiske), gas-fase fragmentationer, kemisk modifikation af enhver monomer i polymersekvensen, tværbinding af monomerer i sekvensen, vilkårlige massesøgninger, beregning af det isotopiske mønster ...

mineXpert:

 - Åbn datafiler med massespektrometri (mzML, mzXML, asc, xy ...)
 - Beregn og vis TIC-kromatogram
 - For mobile data, beregn og vis et mz=f(dt)-farvekort
 - Integrer dataene fra TIC-kromatogrammet eller farvekortet
   - med massespektrum
   - med driftspektrum
   - tilbage til TIC-kromatogram (XIC-kromatogram)
   - vendte operationer
   - til enkelt TIC-intensistetsværdi
 - Modelcentroidetoppe til massespektra via enten gaussisk model eller
   lorentziansk model
 - Eksporter dataene til tekstfiler
 - Opdel en stor fil til mindre dele for nemmere undersøgelse
 - Definer hvordan undersøgelsesaktivitet optages på disken for senere brug
 - Konverter mzML-filer til et privat (men dog åbent) format for
   massespektrometri, som tillader bedre ydelse (baseret på SQLite3)

Denne pakke afhænger af både massXpert og mineXpert og vil derfor installere begge. For kun at installere en af dem, så installer henholdsvis msxpertsuite-massxpert eller msxpertsuite-minexpert.

Tags: Interface Toolkit: Qt

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):