[ Source: python-bx ]
Package: python3-bx (0.8.9-1)
Links for python3-bx
Debian Resources:
Download Source Package python-bx:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning
Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:
* Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local- sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater) * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle sammenligninger i store filer; optimeret for brug over netværksfilsystemer * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse, men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt eller alle ikke satte bit for kompakt lagring * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation
Other Packages Related to python3-bx
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.11)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
-
- dep: python3-lzo
- Python bindings for the LZO data compression library (Python 3)
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-six (>= 1.13.0)
- Python 2- og 3-kompatibilitetsbibliotek - Python 3-grænseflade
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download python3-bx
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
mipsel | 1,805.3 kB | 4,535.0 kB | [list of files] |