Package: infernal (1.1.4-1)

Logisk slutning for RNA-sekundære struktursammenligninger

Infernal (»INFERence of RNA Alignment«) søger i DNA-sekvensdatabaser efter RNA-strukturer og sekvensligheder. Programmet tilbyder en implementering af et specielt tilfælde af profilstokastisk kontekstfri grammatik kaldt covariansmodeller (CM'er). En CM er som en sekvensprofil, men den scorer en kombination af sekvenskonsensus og RNA sekundær strukturkoncensus, så i mange tilfælde, er den bedre til at identificere RNA-homologer som bevarer deres sekundære struktur bedre end deres primære sekvens.

Værktøjet er en integreret komponent i Rfam-databasen.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):