[ Source: trinityrnaseq ]
Package: trinityrnaseq-examples (2.11.0+dfsg-6)
Links for trinityrnaseq-examples
Debian Resources:
Download Source Package trinityrnaseq:
- [trinityrnaseq_2.11.0+dfsg-6.dsc]
- [trinityrnaseq_2.11.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [trinityrnaseq_2.11.0+dfsg-6.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [trinityrnaseq.github.io]
Similar packages:
NA-Seq De novo Assembly - fælles eksempel- og testfiler
Trinity repræsenterer en hidtil ukendt fremgangsmåde til effektiv og robust de novo-rekonstruktion af transkriptomer fra RNA-seq-data. Trinity kombinerer tre uafhængige programmoduler: Inchworm, Chrysalis, og Butterfly, anvendt sekventielt til at behandle store mængder af RNA-seq-læsninger. Trinity partitionerer sekvensdata i mange individuelle de Bruijn-grafer, der hver repræsenterer transkriptionel kompleksitet ved et givet gen eller locus, og derefter behandler hver graf uafhængigt for at udvinde fuld længde-isoformer ved splejsning og drille aparte transkripter afledt af paraloge gener.
Denne pakke indeholder test- og eksempelfiler.
Other Packages Related to trinityrnaseq-examples
|
|
|
|
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: r-base-core
- GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
-
- rec: trinityrnaseq
- RNA-Seq De novo Assembly
Download trinityrnaseq-examples
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 249,151.7 kB | 398,741.0 kB | [list of files] |