Package: changeo (1.0.2-1)
Links for changeo
Debian Resources:
Download Source Package changeo:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [changeo.readthedocs.io]
Similar packages:
Repertoire klonal assignment toolkit - Python 3
Change-O er en samling af værktøjer til at behandle resultatet fra V(D)J-sammenligningsværktøjer, tildele klonale klynger til immunglobulin-sekvenser (Ig) og genkonstruktion til germline-sekvenser.
Dramatiske forbedringer i høj-gennemløb sekvensteknologier aktiverer nu karakterisering af Ig-repertoirer i stor skala, defineret som samlingen af trans-membran antigen-receptor proteiner placeret på overfladen af B-celler og T-celler. Change-O er en pakke af redskaber til at facilitere avanceret analyse af Ig- og TCR-sekvenser, der følger germline-segmentsammenligning. Change-O håndterer resultatet fra IMGT/HighV-QUEST og IgBLAST og tilbyder en bred vifte af klyngemetoder for tildeling af klonale grupper til Ig-sekvenser. Postsortering, gruppering og diverse databasemanipuleringsoperationer er også indeholdt.
Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.
Other Packages Related to changeo
|
|
|
|
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-airr
- Data Representation Standard-bibliotek for antibody- og TCR-sekvenser
-
- dep: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-pandas
- Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
-
- dep: python3-pkg-resources
- Pakkesøgning og ressourceadgang med brug af pkg_resources
-
- dep: python3-presto
- Værktøjssæt til at behandle B- og T-cellesekvenser - Python 3-modul
-
- dep: python3-scipy
- Videnskabelige værktøjer for Python 3
-
- dep: python3-yaml
- YAML-fortolker og udleder for Python 3
-
- rec: python3-biopython (>= 1.65)
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- rec: python3-pandas (>= 0.15)
- Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
-
- rec: python3-presto (>= 0.6.2)
- Værktøjssæt til at behandle B- og T-cellesekvenser - Python 3-modul
Download changeo
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 103.8 kB | 691.0 kB | [list of files] |