Package: r-bioc-shortread (1.48.0-2)

Links for r-bioc-shortread

Debian Resources:

Download Source Package r-bioc-shortread:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [bioconductor.org]

Similar packages:

GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

Dette BioConductor-modul er en pakke for inddata, kvalitetsvurdering, manipulering og uddata for høj-gennemløb sekventeringsdata. ShortRead tilbydes i R- og BioConductor-miljøerne, hvilket giver klar adgang til yderligere faciliteter for avanceret statistisk analyse, datatransformation, visualisering og integration med diverse genomressourcer.

Other Packages Related to r-bioc-shortread

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.7)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

GCC støttebibliotek
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: r-api-4.0

virtual package provided by r-base-core
dep: r-api-bioc-3.12

virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
dep: r-bioc-biobase

Grundlæggende funktioner for Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)

Generiske funktioner for Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor - faciliteter for parallel evulering
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer
dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)

Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller
dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
dep: r-bioc-rhtslib

HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)

BioConductor S4-implementering af vektorer og lister
dep: r-bioc-xvector

BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser
dep: r-bioc-zlibbioc

(Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke
dep: r-cran-hwriter

HTML Writer - R-objekter i HTML-format
dep: r-cran-lattice

GNU R-pakke for »Trellis«-grafik
dep: r-cran-latticeextra

GNU R-pakke for yderligere grafiske visninger baseret på lattice
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

rec: r-cran-runit

GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

sug: r-bioc-biocstyle

Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter
sug: r-bioc-biomart

GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

Download r-bioc-shortread

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	5,004.1 kB	7,433.0 kB	[list of files]