all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: seqtools  ]

Package: blixem (4.44.1+dfsg-6 and others)

Links for blixem

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package seqtools:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Interaktiv browser for sekvenssammenligninger

Blixem er en interaktiv browser for sekvenssammenligninger, som er blevet stablet op i en »master-slave« multiple-sammenligning; det er ikke en »sand« multiple-sammenligning men en »en til mange«-sammenligning.

 * Overblikssektion der viser positionerne for gener og sammenligninger
   omkring sammenligningsvinduet
 * Detaljesektion der viser den faktiske sammenligning af proteinsekvenser
   eller nukleotid sekvenser til den genomiske DNA-sekvens
 * Vis sammenligninger mod begge tråde af referencesekvensen
 * Vis sekvenser i nukleotid eller proteintilstand; i proteintilstand vil
   Blixem vise tre-ramme oversættelsen af referencesekvensen
 * Rester fremhæves i forskellige farver afhængig af om de er præcise
   match, bevaret erstatning eller uden match
 * Hullede sammenligninger er understøttet, med indsættelser og sletning
   før fremhævelse i matchsekvensen
 * Matchninger kan sorteres og filtreres
 * SNP'er og andre variationer kan fremhæves i referencesekvensen
 * Poly(A)-haler kan vises og poly(A)-signaler fremhævet i
   referencesekvensen

Tags: Interface Toolkit: GTK

Other Packages Related to blixem

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download blixem

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
armel 4.44.1+dfsg-6+b1 1,299.1 kB2,072.0 kB [list of files]