[ buster ] [ bullseye ] [ bullseye-backports ] [ bookworm ] [ trixie ] [ sid ]

[ Source: ncbi-blast+ ]

Package: ncbi-blast+ (2.11.0+ds-1)

Links for ncbi-blast+

Debian Resources:

Download Source Package ncbi-blast+:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Olivier Sallou (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Aaron M. Ucko (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.ncbi.nlm.nih.gov]

Similar packages:

Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) er det mest udbredte sekvenssammenligningsværktøj. Der er versioner af BLAST som sammenligner proteinforespørgsler med proteindatabaser, nukleotide forespørgsler med nukleotide databaser samt versioner som oversætter nukleotide forepørgsler eller databaser i alle seks rammer og sammenligner med proteindatabaser eller forespørgsler. PSI-BLAST fremstiller en position-specifik-bedømmelse-matrix (PSSM) der starter med en proteinforespørgsel, og bruger så PSSM til at udføre yderligere søgninger. Det er også muligt at sammenligne en protein- eller nukleotidforespørgsel med en database med PSSM'er. NCBI'en understøtter en BLAST-hjemmeside på blast.ncbi-nlm.nih.gov samt en netværkstjeneste.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::analysing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to ncbi-blast+

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

GCC støttebibliotek
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

Lightning Memory-Mapped Database - delt bibliotek
dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)

Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - crypto-bibliotek
dep: libmbedtls12 (>= 2.13)

Simpelt crypto- og SSL/TLS-bibliotek - tls-bibliotek
dep: libpcre3

Ældre Perl 5-kompatibelt regulært udtryksbibliotek - kørselstidsfiler
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: ncbi-data

Platformsuafhængige data for NCBI-værktøjssættet
dep: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

enh: t-coffee

Flersekvensjustering

Download ncbi-blast+

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	11,027.6 kB	48,457.0 kB	[list of files]