[ Source: seqan-raptor ]
Package: seqan-raptor (2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3)
Links for seqan-raptor
Debian Resources:
Download Source Package seqan-raptor:
- [seqan-raptor_2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3.dsc]
- [seqan-raptor_2.0.0.0.git.fecfbca+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Præfilter til at forespørge meget store samlinger af nukleotidsekvenser
Raptor er et system for omtrentligt at søge i mange forespørgsler som f.eks næstegenerations sekventeringslæsninger eller transskriptioner i store samlinger af nukleotidsekvenser. Raptor bruger winnowing-minimeringsprogrammer til at definere et sæt af repræsentative k-mer'er, en forlængelse af de indflettede Bloom-filtre (IBF'er) som en fastsat medlemsdatastruktur og sandsynlighedstærskelværdi for minimeringsprogrammer. Denne fremgangsmåde tillader komprimering og partitionering af IBF'en for at aktivere effektiv brug af sekundær hukommelse.
Other Packages Related to seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 12)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download seqan-raptor
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 591.3 kB | 2,858.0 kB | [list of files] |