Package: poa (2.0+20060928-8)

Partial Order Alignment for flere sekvenssammenligninger

POA er Partial Order Alignment, et hurtigt program for flere sekvenssammenligninger (MSA) i bioinformatik. Dets fordele er hastighed, skalabilitet, sensitivitet og den overlegne evne til at håndtere forgrening/indels i sammenligningen. Delvis rækkesammenligning er en tilgang til MSA, som kan kombineres med de eksisterende metoder, såsom gradvis sammenligning. POA sammenligner optimalt et par MSA'er, og kan derfor anvendes direkte til progressive sammenligningsmetoder såsom CLUSTAL. For store sammenligninger er Progressive POA 10-30 gange hurtigere end CLUSTALW.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):