all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: centrifuge  ]

Package: centrifuge (1.0.3-11)

Links for centrifuge

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package centrifuge:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Hurtigt og hukommelseseffektivt system til klassifikation af DNA-sekvenser

Centrifuge er et meget hurtigt og hukommelseseffektivt system for klassifikation af DNA-sekvenser fra mikrobielle prøver, med bedre sensitivitet end og sammenlignelig præcision til andre ledende systemer. Systemet bruger et nyt indekseringsskema baseret på Burrows-Wheeler transform (BWT) og Ferragina-Manzini-indeks (FM), optimeret specifikt for det metagenomiske klassifikationsproblem. Centrifuge kræver et relativt lille indeks (f.eks. 4.3 GB for ~4,100 bakteriegenomer) men tilbyder meget hurtig klassifikationshastighed, så programmet kan behandle en typisk DNA-sekvenskørsel på en time. Sammen aktiverer disse fremskridt en præcis analyse af store metagenomiske datasæt på konventionelle skrivebordscomputere.

Other Packages Related to centrifuge

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download centrifuge

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
ppc64el 564.0 kB1,853.0 kB [list of files]