[ Source: r-bioc-genomicranges ]
Package: r-bioc-genomicranges (1.50.2+dfsg-1)
Links for r-bioc-genomicranges
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-genomicranges:
- [r-bioc-genomicranges_1.50.2+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-genomicranges_1.50.2+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-genomicranges_1.50.2+dfsg-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller
Mulighed for effektivt at lagre genomannotationer og sammenligninger spiller en central rolle, når det kommer til at analysere sekventeringsdata med høj gennemløb (a.k.a. NGS-data). Pakken definerer almene containere til at lagre genomintervaller samt mere specialiserede containere til at lagre sammenligninger mod et referencegenom.
Other Packages Related to r-bioc-genomicranges
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.16
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)
- GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)
- Generiske funktioner for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.31.2)
- GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4-implementering af vektorer og lister
-
- dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)
- BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser
-
- sug: r-bioc-annotate
- BioConductor-annotation for microarray'er
-
- sug: r-bioc-annotationdbi
- GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor
-
- sug: r-bioc-annotationhub
- GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer
-
- sug: r-bioc-biobase
- Grundlæggende funktioner for Bioconductor
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter
-
- sug: r-bioc-biostrings (>= 2.25.3)
- GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser
-
- sug: r-bioc-bsgenome
- BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker
-
- sug: r-bioc-deseq2
- R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
-
- sug: r-bioc-dexseq
- GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq
-
- sug: r-bioc-edger
- Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R
-
- sug: r-bioc-genomicalignments
- Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger
-
- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer
-
- sug: r-bioc-gviz
- Plot data og annotationsinformation langs genomiske koordinater
-
- sug: r-bioc-keggrest
- GNU R-REST-adgang på klientsiden til KEGG
-
- sug: r-bioc-rsamtools (>= 1.13.53)
- GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport
-
- sug: r-bioc-rtracklayer
- GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor
-
- sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 0.1.5)
- BioConductor - assay-container
-
- sug: r-bioc-variantannotation
- BioConductor-annotation af genetiske varianter
-
- sug: r-cran-digest
- GNU R package for 'hash digest' of R data structures
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
-
- sug: r-cran-matrix
- GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- sug: r-cran-runit
- GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest
Download r-bioc-genomicranges
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armel | 1,751.3 kB | 2,758.0 kB | [list of files] |