Пакет: seqan-raptor (3.0.1+ds-5)

Връзки за seqan-raptor

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник seqan-raptor.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences

Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.

Други пакети, свързани с seqan-raptor

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [arm64, ppc64el]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0)

YAML parser and emitter for C++
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

sug: cwl-runner

виртуален пакет, предлаган от cwltool, toil

Изтегляне на seqan-raptor

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	646,1 кБ	2 087,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	551,8 кБ	1 911,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	529,1 кБ	2 319,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	633,6 кБ	2 359,0 кБ	[списък на файловете]