[ Източник: pairtools ]
Пакет: python3-pairtools (1.0.3-1 и други)
Връзки за python3-pairtools
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник pairtools.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end sequences of Hi-C DNA molecules - Sort .pairs files for downstream analyses - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates - Generate extensive statistics of Hi-C datasets - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria - Restore .sam alignments from Hi-C pairs
Други пакети, свързани с python3-pairtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.12~)
-
- dep: python3-bioframe
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
-
- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: python3-numpy-abi9
- виртуален пакет, предлаган от python3-numpy
-
- dep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
-
- dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~)
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: python3-yaml
- YAML parser and emitter for Python3
-
- sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)
- Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)
Изтегляне на python3-pairtools
Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|---|
ppc64el | 1.0.3-1+b2 | 189,6 кБ | 956,0 кБ | [списък на файловете] |