Пакет: spaln (3.0.2+dfsg-2 и други)

Връзки за spaln

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник spaln.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Други пакети, свързани с spaln

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [не hppa, m68k, sh4, x32]

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: spaln-data

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

compression library - runtime

Изтегляне на spaln

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	3.0.2+dfsg-2	527,4 кБ	2 362,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	3.0.2+dfsg-2	550,0 кБ	1 901,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3.0.2+dfsg-2	492,8 кБ	2 230,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.4.7+dfsg-1	330,7 кБ	799,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	3.0.2+dfsg-2	679,9 кБ	3 602,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2.4.7+dfsg-1	306,2 кБ	811,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3.0.2+dfsg-2	529,1 кБ	2 342,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3.0.2+dfsg-2	555,4 кБ	2 690,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3.0.2+dfsg-2	561,4 кБ	2 615,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3.0.2+dfsg-2	652,4 кБ	3 349,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3.0.2+dfsg-2	567,8 кБ	2 024,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2.4.7+dfsg-1	373,7 кБ	713,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	3.0.2+dfsg-2	502,1 кБ	14 483,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.4.7+dfsg-1	337,2 кБ	813,0 кБ	[списък на файловете]