[ 原始碼： spaln ]
套件：spaln（3.0.2+dfsg-2 以及其他的）
splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA
Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.
spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.
其他與 spaln 有關的套件
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]
- GCC 支援函式庫
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [除 hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 支援函式庫
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 支援函式庫
-
- dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [除 hppa, m68k, sh4, x32]
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
-
- dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]
- GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: spaln-data
- splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- 壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)
下載 spaln
| 硬體架構 | 版本 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
|---|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 3.0.2+dfsg-2 | 527。4 kB | 2，362。0 kB | [檔案列表] |
| amd64 | 3.0.2+dfsg-2 | 550。0 kB | 1，901。0 kB | [檔案列表] |
| arm64 | 3.0.2+dfsg-2 | 492。8 kB | 2，230。0 kB | [檔案列表] |
| hppa （非官方移植版） | 2.4.7+dfsg-1 | 330。7 kB | 799。0 kB | [檔案列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 3.0.2+dfsg-2 | 679。9 kB | 3，602。0 kB | [檔案列表] |
| m68k （非官方移植版） | 2.4.7+dfsg-1 | 306。2 kB | 811。0 kB | [檔案列表] |
| mips64el | 3.0.2+dfsg-2 | 529。1 kB | 2，342。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 3.0.2+dfsg-2 | 555。4 kB | 2，690。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64el | 3.0.2+dfsg-2 | 561。4 kB | 2，615。0 kB | [檔案列表] |
| riscv64 | 3.0.2+dfsg-2 | 652。4 kB | 3，349。0 kB | [檔案列表] |
| s390x | 3.0.2+dfsg-2 | 567。8 kB | 2，024。0 kB | [檔案列表] |
| sh4 （非官方移植版） | 2.4.7+dfsg-1 | 373。7 kB | 713。0 kB | [檔案列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 3.0.2+dfsg-2 | 502。1 kB | 14，483。0 kB | [檔案列表] |
| x32 （非官方移植版） | 2.4.7+dfsg-1 | 337。2 kB | 813。0 kB | [檔案列表] |