Пакет: mmseqs2 (15-6f452+ds-2 и други)

Връзки за mmseqs2

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник mmseqs2.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

ultra fast and sensitive protein search and clustering

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.

Други пакети, свързани с mmseqs2

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libatomic1 (>= 4.8) [не ppc64, ppc64el, sparc64, x32]

support library providing __atomic built-in functions
dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64, x32]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64, sparc64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [не amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: libzstd1 (>= 1.3.8) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sparc64]

fast lossless compression algorithm

dep: libzstd1 (>= 1.4.0) [sh4, x32]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]

compression library - runtime

dep: zlib1g (>= 1:1.2.6) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]

Изтегляне на mmseqs2

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	12-113e3+ds-3+b1	4 605,9 кБ	9 018,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	15-6f452+ds-2	23 636,6 кБ	70 261,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	15-6f452+ds-2	6 907,5 кБ	15 678,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	12-113e3+ds-2+b1	4 494,2 кБ	7 857,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	15-6f452+ds-2	7 602,6 кБ	23 212,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	12-113e3+ds-2+b1	4 368,5 кБ	7 775,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	15-6f452+ds-2	6 896,2 кБ	16 735,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	12-113e3+ds-2+b1	4 402,7 кБ	8 061,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	15-6f452+ds-2	7 167,0 кБ	17 022,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	15-6f452+ds-2+b1	7 315,2 кБ	15 559,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	12-113e3+ds-3+b1	4 800,2 кБ	7 324,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	11-e1a1c+ds-4	4 158,7 кБ	7 066,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	12-113e3+ds-3+b1	4 529,1 кБ	7 777,0 кБ	[списък на файловете]