Пакет: mmseqs2 (15-6f452+ds-2 и другие)

Ссылки для mmseqs2

Ресурсы Debian:

Исходный код mmseqs2:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

ultra fast and sensitive protein search and clustering

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.

Другие пакеты, относящиеся к mmseqs2

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libatomic1 (>= 4.8) [не ppc64, ppc64el, sparc64, x32]

библиотека для атомарного выполнения кода
dep: libbz2-1.0

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64, x32]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64, sparc64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

dep: libstdc++6 (>= 9) [не amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: libzstd1 (>= 1.3.8) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sparc64]

быстрый алгоритм сжатия без потерь

dep: libzstd1 (>= 1.4.0) [sh4, x32]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]

библиотека сжатия

dep: zlib1g (>= 1:1.2.6) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64]

Загрузка mmseqs2

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	12-113e3+ds-3+b1	4 605,9 Кб	9 018,0 Кб	[список файлов]
amd64	15-6f452+ds-2	23 636,6 Кб	70 261,0 Кб	[список файлов]
arm64	15-6f452+ds-2	6 907,5 Кб	15 678,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	12-113e3+ds-2+b1	4 494,2 Кб	7 857,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	15-6f452+ds-2	7 602,6 Кб	23 212,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	12-113e3+ds-2+b1	4 368,5 Кб	7 775,0 Кб	[список файлов]
mips64el	15-6f452+ds-2	6 896,2 Кб	16 735,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	12-113e3+ds-2+b1	4 402,7 Кб	8 061,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	15-6f452+ds-2	7 167,0 Кб	17 022,0 Кб	[список файлов]
riscv64	15-6f452+ds-2+b1	7 315,2 Кб	15 559,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	12-113e3+ds-3+b1	4 800,2 Кб	7 324,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	11-e1a1c+ds-4	4 158,7 Кб	7 066,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	12-113e3+ds-3+b1	4 529,1 Кб	7 777,0 Кб	[список файлов]