Пакет: blasr (5.3.5+dfsg-6 и други)

Връзки за blasr

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник blasr.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Други пакети, свързани с blasr

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libblasr [x32]

tools for aligning PacBio reads to target sequences
dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg) [не hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

tools for aligning PacBio reads to target sequences
dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, ppc64]

dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]

Пакетът не е наличен

dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sh4]
dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

Пакетът не е наличен
dep: libhdf5-10 [hppa, ppc64]

Пакетът не е наличен
dep: libhdf5-100 [x32]

Пакетът не е наличен
dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0) [x32]

Пакетът не е наличен
dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1) [m68k, sh4]

HDF5 - C++ runtime files - serial version (transitional package)
dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5) [не hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

HDF5 - C++ runtime files - serial version
dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.15-patch1) [ppc64]

Пакетът не е наличен

dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.16) [hppa]
dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg) [m68k, sh4]

Пакетът не е наличен
dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg) [не hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [не hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libpbdata [x32]

tools for handling PacBio sequences
dep: libpbihdf [x32]

tools for handling PacBio hdf5 files
dep: libpbseq [m68k, sh4]

library for analyzing PacBio sequencing data

dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~) [не hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, ppc64, x32]

compression library - runtime

Изтегляне на blasr

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	5.3.5+dfsg-6+b4	211,9 кБ	744,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	5.3.5+dfsg-6+b3	219,0 кБ	664,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	5.3.5+dfsg-6+b3	190,0 кБ	616,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1 423,6 кБ	6 078,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	5.3.5+dfsg-6+b4	271,0 кБ	1 226,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	5.3.3+dfsg-1+b1	180,6 кБ	591,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	5.3.5+dfsg-6+b3	197,4 кБ	760,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1 367,5 кБ	6 824,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	5.3.5+dfsg-6+b3	215,2 кБ	744,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	5.3.5+dfsg-6+b1	216,3 кБ	528,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	5.3.3+dfsg-1+b1	223,0 кБ	543,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	5.3-1+b1	459,5 кБ	1 607,0 кБ	[списък на файловете]