Paketti: blasr (5.3.5+dfsg-6 ja muut)

Links for blasr

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti blasr:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Muut pakettiin blasr liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libblasr [x32]

tools for aligning PacBio reads to target sequences
dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

tools for aligning PacBio reads to target sequences
dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, ppc64]

dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]

Paketti ei saatavilla

dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sh4]
dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

Paketti ei saatavilla
dep: libhdf5-10 [hppa, ppc64]

Paketti ei saatavilla
dep: libhdf5-100 [x32]

Paketti ei saatavilla
dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0) [x32]

Paketti ei saatavilla
dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1) [m68k, sh4]

HDF5 - C++ runtime files - serial version (transitional package)
dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

HDF5 - C++ runtime files - serial version
dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.15-patch1) [ppc64]

Paketti ei saatavilla

dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.16) [hppa]
dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg) [m68k, sh4]

Paketti ei saatavilla
dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libpbdata [x32]

tools for handling PacBio sequences
dep: libpbihdf [x32]

tools for handling PacBio hdf5 files
dep: libpbseq [m68k, sh4]

library for analyzing PacBio sequencing data

dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, ppc64, x32]

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi blasr

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	5.3.5+dfsg-6+b4	211.9 kt	744.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	5.3.5+dfsg-6+b3	219.0 kt	664.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	5.3.5+dfsg-6+b3	190.0 kt	616.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1,423.6 kt	6,078.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	5.3.5+dfsg-6+b4	271.0 kt	1,226.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	5.3.3+dfsg-1+b1	180.6 kt	591.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	5.3.5+dfsg-6+b3	197.4 kt	760.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1,367.5 kt	6,824.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	5.3.5+dfsg-6+b3	215.2 kt	744.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	5.3.5+dfsg-6+b1	216.3 kt	528.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	5.3.3+dfsg-1+b1	223.0 kt	543.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	5.3-1+b1	459.5 kt	1,607.0 kt	[tiedostoluettelo]