Пакет: pizzly (0.37.3+ds-9)

Връзки за pizzly

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник pizzly.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

Identifies gene fusions in RNA sequencing data

For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.

Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.

Други пакети, свързани с pizzly

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: kallisto

near-optimal RNA-Seq quantification
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 12)

GNU Standard C++ Library v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

rec: python3-h5py

general-purpose Python interface to hdf5

Изтегляне на pizzly

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
ppc64el	285,1 кБ	992,0 кБ	[списък на файловете]