[ Източник: optimir ]
Пакет: optimir (1.2-2)
Връзки за optimir
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник optimir.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
Integrating genetic variations in miRNA alignment
OptimiR is a miRSeq data alignment workflow. It integrates genetic information to assess the impact of variants on miRNA expression.
OptimiR: A bioinformatics pipeline designed to detect and quantify miRNAs, isomiRs and polymiRs from miRSeq data, & study the impact of genetic variations on polymiRs' expression.
Други пакети, свързани с optimir
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cutadapt
- Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- rec: r-cran-gridextra
- GNU R package with extensions for the grid package
Изтегляне на optimir
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| all | 1 002,4 кБ | 7 403,0 кБ | [списък на файловете] |