Пакет: fastahack (1.0.0+dfsg-11 и други)

Връзки за fastahack

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник libfastahack.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

utility for indexing and sequence extraction from FASTA files

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

Други пакети, свързани с fastahack

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [не amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на fastahack

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	11,7 кБ	84,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b1	12,3 кБ	41,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b1	11,8 кБ	85,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0.0+dfsg-11+b1	11,7 кБ	36,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b1	11,6 кБ	36,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	11,9 кБ	36,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0.0+dfsg-11+b1	12,5 кБ	44,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	13,3 кБ	49,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	11,9 кБ	43,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b1	12,1 кБ	86,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	12,1 кБ	84,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b1	12,3 кБ	85,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b1	11,7 кБ	37,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b1	12,2 кБ	41,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	12,5 кБ	83,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	11,5 кБ	1 045,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	12,0 кБ	39,0 кБ	[списък на файловете]