Пакет: bandage (0.9.0-2 и други)

Връзки за bandage

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник bandage.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [rrwick.github.io]

Подобни пакети:

Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily

Bandage is a GUI program that allows users to interact with the assembly graphs made by de novo assemblers such as Velvet, SPAdes, MEGAHIT and others.

De novo assembly graphs contain not only assembled contigs but also the connections between those contigs, which were previously not easily accessible. Bandage visualises assembly graphs, with connections, using graph layout algorithms. Nodes in the drawn graph, which represent contigs, can be automatically labelled with their ID, length or depth. Users can interact with the graph by moving, labelling and colouring nodes. Sequence information can also be extracted directly from the graph viewer. By displaying connections between contigs, Bandage opens up new possibilities for analysing and improving de novo assemblies that are not possible by looking at contigs alone.

More information and download links are on the Bandage website: rrwick.github.io/Bandage

The package is relevant to the field of genome assembly.

Етикети: Interface Toolkit: Qt

Други пакети, свързани с bandage

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [не arm64, hppa, ia64, m68k, mips64el, riscv64]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libgl1 [sparc64]

Vendor neutral GL dispatch library -- legacy GL support
dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1)

Qt 5 core module
dep: libqt5gui5t64 (>= 5.8.0)

Qt 5 GUI module

или libqt5gui5-gles (>= 5.8.0)

Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
dep: libqt5svg5 (>= 5.6.0~beta)

Qt 5 SVG module
dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.15.1)

Qt 5 widgets module
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на bandage

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	914,8 кБ	2 722,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.9.0-2+b1	964,0 кБ	2 328,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.9.0-2+b2	902,9 кБ	2 338,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.9.0-2+b1	874,9 кБ	2 109,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.9.0-2+b1	876,7 кБ	1 677,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	956,9 кБ	2 511,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.9.0-2+b1	993,9 кБ	2 336,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	1 035,7 кБ	4 198,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	942,8 кБ	2 340,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.9.0-2+b1	904,4 кБ	2 896,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	944,9 кБ	2 923,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.9.0-2+b1	952,1 кБ	2 719,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.9.0-2+b3	964,2 кБ	1 968,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.9.0-2+b1	953,2 кБ	2 395,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	1 089,7 кБ	2 334,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	838,8 кБ	3 122,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.9.0-2+b1	959,3 кБ	2 215,0 кБ	[списък на файловете]