Пакет: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-2)

Връзки за tvc

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник tvc.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [ioncommunity.thermofisher.com]

Подобни пакети:

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Други пакети, свързани с tvc

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libarmadillo9 (>= 1:9.200.6+dfsg)

streamlined C++ linear algebra library
dep: libbamtools2.5.1

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libblas3

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

или libblas.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base
dep: libc6 (>= 2.27)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, i386]

GCC support library

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

dep: libgcc1 (>= 1:4.5) [arm64]
dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

library for reading and writing JSON for C++
dep: liblapack3

Library of linear algebra routines 3 - shared version

или liblapack.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ Library v3
dep: python

interactive high-level object-oriented language (Python2 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

Изтегляне на tvc

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1 033,9 кБ	3 316,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	966,0 кБ	3 117,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	935,2 кБ	2 581,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1 064,7 кБ	3 372,0 кБ	[списък на файловете]