всички настройки
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: seer  ]

Пакет: seer (1.1.4-2 и други)

Връзки за seer

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник seer.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

genomic sequence element (kmer) enrichment analysis

Bacterial genomes vary extensively in terms of both gene content and gene sequence - this plasticity hampers the use of traditional SNP-based methods for identifying all genetic associations with phenotypic variation. SEER provides a computationally scalable and widely applicable statistical method for the identification of sequence elements that are significantly enriched in a phenotype of interest. SEER is applicable to even tens of thousands of genomes by counting variable- length k-mers using a distributed string-mining algorithm. Robust options are provided for association analysis that also correct for the clonal population structure of bacteria. Using large collections of genomes of the major human pathogen Streptococcus pneumoniae, SEER identifies relevant previously characterised resistance determinants for several antibiotics.

Други пакети, свързани с seer

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на seer

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 1.1.4-2+b2 397,1 кБ1 716,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1.1.4-2+b2 361,0 кБ1 568,0 кБ [списък на файловете]
armhf 1.1.4-2+b2 320,1 кБ1 039,0 кБ [списък на файловете]
i386 1.1.4-2+b2 405,3 кБ1 695,0 кБ [списък на файловете]