Пакет: tiddit (2.12.0+dfsg-3 и други)

Връзки за tiddit

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник tiddit.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

structural variant calling

TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs.

TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.

Други пакети, свързани с tiddit

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.17)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU Standard C++ Library v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)

Изтегляне на tiddit

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
arm64	2.12.0+dfsg-3+b1	206,7 кБ	835,0 кБ	[списък на файловете]