Пакет: libfreecontact0v5 (1.0.21-13)

Връзки за libfreecontact0v5

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник freecontact.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [rostlab.org]

Подобни пакети:

fast protein contact predictor library

FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).

FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.

A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.

jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.

This package contains the shared library implementing freecontact.

Етикети: Role: Shared Library

Други пакети, свързани с libfreecontact0v5

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libblas3

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

или libblas.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgfortran5 (>= 8)

Runtime library for GNU Fortran applications
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: liblapack3

Library of linear algebra routines 3 - shared version

или liblapack.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на libfreecontact0v5

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	74,3 кБ	194,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	66,0 кБ	217,0 кБ	[списък на файловете]
armel	57,2 кБ	153,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	57,8 кБ	121,0 кБ	[списък на файловете]
i386	64,3 кБ	173,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	65,0 кБ	224,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	66,5 кБ	223,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	81,1 кБ	218,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	67,3 кБ	198,0 кБ	[списък на файловете]