Пакет: skewer (0.2.2-6 и други)

Връзки за skewer

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник skewer.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Други пакети, свързани с skewer

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на skewer

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	0.2.2-6+b1	86,4 кБ	216,0 кБ	[списък на файловете]