套件：repeatmasker-recon（1.08-8）

repeatmasker-recon 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 repeatmasker-recon：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [www.repeatmasker.org]

相似套件：

finds repeat families from biological sequences

The RECON package implements a de novo algorithm for the identification of repeat families from biological sequences.

The program implements an approach for the de novo identification and classification of repeat sequence families that is based on extensions to the usual approach of single linkage clustering of local pairwise alignments between genomic sequences. The extensions use multiple alignment information to define the boundaries of individual copies of the repeats and to distinguish homologous but distinct repeat element families. When tested on the human genome, this approach was able to properly identify and group known transposable elements. The program, should be useful for first-pass automatic classification of repeats in newly sequenced genomes.

其他與 repeatmasker-recon 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

下載 repeatmasker-recon

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	82。2 kB	656。0 kB	[檔案列表]
amd64	83。1 kB	460。0 kB	[檔案列表]
arm64	81。1 kB	656。0 kB	[檔案列表]
armel	80。6 kB	451。0 kB	[檔案列表]
armhf	77。9 kB	407。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	81。0 kB	442。0 kB	[檔案列表]
i386	84。9 kB	471。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	87。8 kB	533。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	76。6 kB	427。0 kB	[檔案列表]
mips64el	84。6 kB	669。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	85。4 kB	656。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	85。3 kB	656。0 kB	[檔案列表]
riscv64	83。1 kB	432。0 kB	[檔案列表]
s390x	81。2 kB	456。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	79。8 kB	651。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	79。1 kB	5，460。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	82。5 kB	455。0 kB	[檔案列表]