套件：cat-bat（5.3-2）

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相似套件：

taxonomic classification of contigs and metagenome-assembled genomes (MAGs)

Contig Annotation Tool (CAT) and Bin Annotation Tool (BAT) are pipelines for the taxonomic classification of long DNA sequences and metagenome assembled genomes (MAGs/bins) of both known and (highly) unknown microorganisms, as generated by contemporary metagenomics studies. The core algorithm of both programs involves gene calling, mapping of predicted ORFs against the nr protein database, and voting-based classification of the entire contig / MAG based on classification of the individual ORFs. CAT and BAT can be run from intermediate steps if files are formatted appropriately.

其他與 cat-bat 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: diamond-aligner

accelerated BLAST compatible local sequence aligner
dep: prodigal

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

下載 cat-bat

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
amd64	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
arm64	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
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m68k （非官方移植版）	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
riscv64	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
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sparc64 （非官方移植版）	38。5 kB	199。0 kB	[檔案列表]
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