套件：miniasm（0.3+dfsg-4 以及其他的）

miniasm 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 miniasm：

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外部的資源：

主頁 [github.com]

相似套件：

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

標籤: 生物學: 核酸, 領域: 生物學, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, 使用者介面: 命令行, 角色: role::program, science::calculation, Purpose: Calculating, use::comparing, works-with::biological-sequence

其他與 miniasm 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

下載 miniasm

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	31。2 kB	83。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.3+dfsg-4	29。2 kB	71。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.3+dfsg-4	26。4 kB	82。0 kB	[檔案列表]
armel	0.3+dfsg-4	27。7 kB	82。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.3+dfsg-4	26。3 kB	82。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	29。3 kB	67。0 kB	[檔案列表]
i386	0.3+dfsg-4	31。2 kB	78。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	38。2 kB	113。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	25。9 kB	66。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.3+dfsg-4	29。7 kB	86。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	32。3 kB	147。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.3+dfsg-4	31。9 kB	83。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.3+dfsg-4+b1	29。9 kB	60。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.3+dfsg-4	28。4 kB	70。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	29。0 kB	82。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	26。4 kB	1，044。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.3+dfsg-4	29。0 kB	70。0 kB	[檔案列表]