[ 原始碼： megadepth ]
套件：megadepth（1.2.0-4 以及其他的）
computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.
This package is a successor of the program 'bamcount'.
其他與 megadepth 有關的套件
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- dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)
- C library for handling bigWig files
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- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]
- easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0) [sparc64]
- fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC 支援函式庫
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 支援函式庫
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ Library v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]
- 壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)
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- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
下載 megadepth
| 硬體架構 | 版本 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
|---|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 1.2.0-4+b1 | 78。4 kB | 276。0 kB | [檔案列表] |
| amd64 | 1.2.0-4+b1 | 81。0 kB | 275。0 kB | [檔案列表] |
| arm64 | 1.2.0-4+b1 | 71。0 kB | 275。0 kB | [檔案列表] |
| armel | 1.2.0-4+b1 | 70。9 kB | 234。0 kB | [檔案列表] |
| armhf | 1.2.0-4+b1 | 72。5 kB | 178。0 kB | [檔案列表] |
| hppa （非官方移植版） | 1.2.0-4+b1 | 80。2 kB | 252。0 kB | [檔案列表] |
| i386 | 1.2.0-4+b1 | 84。1 kB | 274。0 kB | [檔案列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 1.2.0-4+b1 | 99。7 kB | 467。0 kB | [檔案列表] |
| mips64el | 1.2.0-4+b1 | 71。9 kB | 282。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 1.2.0-4+b1 | 81。5 kB | 339。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64el | 1.2.0-4+b1 | 83。3 kB | 339。0 kB | [檔案列表] |
| riscv64 | 1.2.0-4+b2 | 79。8 kB | 219。0 kB | [檔案列表] |
| s390x | 1.2.0-4+b1 | 82。1 kB | 271。0 kB | [檔案列表] |
| sh4 （非官方移植版） | 1.2.0-4+b1 | 91。8 kB | 275。0 kB | [檔案列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 1.2.0-4+b1 | 70。2 kB | 1，047。0 kB | [檔案列表] |
| x32 （非官方移植版） | 1.2.0-4+b1 | 83。8 kB | 258。0 kB | [檔案列表] |