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相似套件:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

其他與 skewer 有關的套件

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下載 skewer

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構 版本 套件大小 安裝後大小 檔案
amd64 0.2.2-6+b1 86。4 kB216。0 kB [檔案列表]
arm64 0.2.2-6+b1 76。4 kB235。0 kB [檔案列表]
armel 0.2.2-6+b1 75。2 kB235。0 kB [檔案列表]
armhf 0.2.2-6+b1 75。5 kB171。0 kB [檔案列表]
i386 0.2.2-6+b1 90。2 kB231。0 kB [檔案列表]
mips64el 0.2.2-6+b1 81。5 kB242。0 kB [檔案列表]
mipsel 0.2.2-6+b1 83。1 kB240。0 kB [檔案列表]
ppc64el 0.2.2-6+b1 84。9 kB236。0 kB [檔案列表]
s390x 0.2.2-6+b1 76。0 kB199。0 kB [檔案列表]