软件包：lumpy-sv（0.3.1+dfsg-7 以及其他的）

lumpy-sv 的相关链接

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相似软件包：

general probabilistic framework for structural variant discovery

LUMPY, a novel SV discovery framework that naturally integrates multiple SV signals jointly across multiple samples. LUMPY yields improved sensitivity, especially when SV signal is reduced owing to either low coverage data or low intra-sample variant allele frequency.

其他与 lumpy-sv 有关的软件包

依赖

推荐

建议

增强

dep: bamkit

tools for common BAM file manipulations
dep: libbamtools2.4.0 [sparc64]

软件包暂时不可用
dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg) [hppa, ppc64]

软件包暂时不可用
dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg) [除 hppa, ppc64, sparc64]

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, ppc64, sparc64]

GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, hppa, ia64, ppc64, sh4, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [hppa, sparc64]

简单易用的客户端 URL 传输软件库（OpenSSL 变种）
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, x32]

GCC 支持库

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支持库
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支持库
dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
dep: libhts3 (>= 1.10) [hppa, ppc64, sparc64]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [除 hppa, ppc64, sparc64]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0) [hppa, sparc64]

软件包暂时不可用
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 hppa, ppc64, sparc64]

GNU 标准 C++ 库，第3版

dep: libstdc++6 (>= 9) [hppa, ppc64, sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: python3

交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）
dep: python3-numpy

Python library for numerical computations (Python 3)
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
dep: samblaster

marks duplicates, extracts discordant/split reads
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, sparc64]

压缩库 - 运行时

rec: sambamba

tools for working with SAM/BAM data

下载 lumpy-sv

下载可用于所有硬件架构的
硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-7+b1	185.1 kB	806.0 kB	[文件列表]
amd64	0.3.1+dfsg-7+b1	205.3 kB	689.0 kB	[文件列表]
arm64	0.3.1+dfsg-7+b1	168.9 kB	677.0 kB	[文件列表]
armel	0.3.1+dfsg-7+b1	162.2 kB	567.0 kB	[文件列表]
armhf	0.3.1+dfsg-7+b1	169.2 kB	443.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-1	192.6 kB	673.0 kB	[文件列表]
i386	0.3.1+dfsg-7+b1	221.6 kB	735.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-7+b1	238.6 kB	1,187.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-7+b1	184.6 kB	627.0 kB	[文件列表]
mips64el	0.3.1+dfsg-7+b1	175.8 kB	777.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-1	182.5 kB	803.0 kB	[文件列表]
ppc64el	0.3.1+dfsg-7+b1	194.5 kB	805.0 kB	[文件列表]
riscv64	0.3.1+dfsg-7+b2	189.7 kB	537.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-7+b1	222.3 kB	676.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-1	151.6 kB	584.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	0.3.1+dfsg-7+b1	211.4 kB	671.0 kB	[文件列表]