[ Source: nanopolish ]
Пакунок: nanopolish (0.14.0-1 and others)
Links for nanopolish
Debian Resources:
Download Source Package nanopolish:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Інші пакунки пов'язані з nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhdf5-103-1t64
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Завантажити nanopolish
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| arm64 | 0.14.0-1+b2 | 2,082.1 kB | 9,475.0 kB | [список файлів] |