Пакунок: kleborate (2.4.1-3 and others)

Links for kleborate

Debian Resources:

Download Source Package kleborate:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

tool to screen Klebsiella genome assemblies

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for:

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

Інші пакунки пов'язані з kleborate

depends

recommends

suggests

enhances

dep: kaptive

obtain information about K and O types for Klebsiella genome assemblies
dep: kaptive-data

reference data for kaptive for Klebsiella genome assemblies
dep: mash

fast genome and metagenome distance estimation using MinHash
dep: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-distutils [m68k]

distutils package for Python 3.x

Завантажити kleborate

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	2.4.1-3	7,558.8 kB	62,170.0 kB	[список файлів]
amd64	2.4.1-3	7,558.8 kB	62,170.0 kB	[список файлів]
arm64	2.4.1-3	7,558.8 kB	62,170.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	2.1.0-2	7,518.1 kB	61,504.0 kB	[список файлів]
mips64el	2.4.1-3	7,558.8 kB	62,170.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	2.4.1-3	7,555.3 kB	62,001.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2.4.1-3	7,558.8 kB	62,170.0 kB	[список файлів]
riscv64	2.4.1-3	7,558.8 kB	62,170.0 kB	[список файлів]
s390x	2.4.1-3	7,555.3 kB	62,001.0 kB	[список файлів]