Пакунок: cd-hit (4.8.1-4)

Links for cd-hit

Debian Resources:

Download Source Package cd-hit:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Tim Booth (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [weizhongli-lab.org]

Similar packages:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Інші пакунки пов'язані з cd-hit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.7)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

Допоміжна бібліотека GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: perl

Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити cd-hit

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
armel	491.0 kB	1,319.0 kB	[список файлів]