Пакунок: python3-dna-jellyfish (2.3.0-10)
Links for python3-dna-jellyfish
Debian Resources:
Download Source Package jellyfish:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Shaun Jackman (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.cbcb.umd.edu]
Similar packages:
count k-mers in DNA sequences (Python bindings of jellyfish)
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.
This package contains the Python bindings of jellyfish.
Інші пакунки пов'язані з python3-dna-jellyfish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.0)
- count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]
-
- dep: python3
- Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
Завантажити python3-dna-jellyfish
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 53.6 kB | 173.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 50.6 kB | 169.0 kB | [список файлів] |
| armel | 52.8 kB | 166.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 53.4 kB | 138.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 60.7 kB | 178.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 52.1 kB | 191.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 56.4 kB | 237.0 kB | [список файлів] |