Пакунок: r-bioc-edger (3.32.1+dfsg-1)

Links for r-bioc-edger

Debian Resources:

Download Source Package r-bioc-edger:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [bioconductor.org]

Similar packages:

Empirical analysis of digital gene expression data in R

Bioconductor package for differential expression analysis of whole transcriptome sequencing (RNA-seq) and digital gene expression profiles with biological replication. It uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution. It is also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::r, interface::commandline, Role: Program

Інші пакунки пов'язані з r-bioc-edger

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libblas3

Реалізації основних підпрограм лінійної алгебри (колективна бібліотека)

or libblas.so.3

virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.29)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Допоміжна бібліотека GCC
dep: liblapack3

Бібліотека підпрограм лінійної алгебри вер. 3 — колективна версія

or liblapack.so.3

virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: r-api-4.0

virtual package provided by r-base-core
dep: r-api-bioc-3.12

virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

GNU R core of statistical computation and graphics system
dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5)

linear models for microarray data
dep: r-cran-locfit

GNU R local regression, likelihood and density estimation
dep: r-cran-rcpp

GNU R package for Seamless R and C++ Integration

rec: r-cran-statmod

GNU R package providing algorithms and functions for statistical modeling

sug: r-bioc-annotationdbi

GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
sug: r-bioc-biobase

base functions for Bioconductor
sug: r-bioc-org.hs.eg.db

genome-wide annotation for Human
sug: r-bioc-rhdf5

BioConductor HDF5 interface to R
sug: r-bioc-summarizedexperiment

BioConductor assay container
sug: r-cran-jsonlite

Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
sug: r-cran-readr

GNU R package to read rectangular text data

Завантажити r-bioc-edger

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
ppc64el	1,050.6 kB	1,447.0 kB	[список файлів]