Пакунок: circlator (1.5.6-5)

Links for circlator

Debian Resources:

Download Source Package circlator:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [sanger-pathogens.github.io]

Similar packages:

circularize genome assemblies

Circlator is a tool to automate assembly circularization for bacterial and small eukaryotic genomes and produce accurate linear representations of circular sequences.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::python, Role: Program, Наука: science::calculation, works-with::biological-sequence, Works with: Файли

Інші пакунки пов'язані з circlator

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bwa (>= 0.7.12)

Burrows-Wheeler Aligner
dep: canu

single molecule sequence assembler for genomes
dep: fastaq (>= 3.12.1)

FASTA and FASTQ file manipulation tools
dep: mummer

Efficient sequence alignment of full genomes
dep: prodigal

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
dep: python3

Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)
dep: python3-openpyxl

Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files
dep: python3-pymummer

Python 3 interface to MUMmer
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: spades

genome assembler for single-cell and isolates data sets

Завантажити circlator

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	4,369.4 kB	10,531.0 kB	[список файлів]