Пакунок: sibelia (3.0.7+dfsg-3)

Links for sibelia

Debian Resources:

Download Source Package sibelia:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [bioinf.spbau.ru]

Similar packages:

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Інші пакунки пов'язані з sibelia

depends

recommends

suggests

enhances

dep: lagan

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

Допоміжна бібліотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 9)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Завантажити sibelia

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	309.7 kB	1,176.0 kB	[список файлів]
arm64	278.3 kB	1,120.0 kB	[список файлів]
armel	283.4 kB	1,139.0 kB	[список файлів]
armhf	289.5 kB	955.0 kB	[список файлів]
i386	312.3 kB	1,151.0 kB	[список файлів]
mips64el	278.1 kB	1,250.0 kB	[список файлів]
mipsel	276.8 kB	1,261.0 kB	[список файлів]
ppc64el	305.1 kB	1,228.0 kB	[список файлів]
s390x	275.7 kB	1,128.0 kB	[список файлів]