Paket: maq (0.7.1-10)

Länkar för maq

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet maq:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Andreas Tille (QA-sida)
Charles Plessy (QA-sida)
Étienne Mollier (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [maq.sourceforge.net]

Liknande paket:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Behöver ett märke till, Analysing, use::comparing, use::searching, Supports Format: Behöver ett märke till, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Andra paket besläktade med maq

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

GCC stödbibliotek
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU standardbibliotek v3 för C++
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Hämta maq

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
ppc64el	303,5 kbyte	645,0 kbyte	[filförteckning]