Paket: spoa (4.1.4-1)

Länkar för spoa

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet spoa:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andra paket besläktade med spoa

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC stödbibliotek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC stödbibliotek
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

SIMD partial order alignment library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU standardbibliotek v3 för C++
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ej armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Hämta spoa

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	35,9 kbyte	98,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	37,2 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	36,0 kbyte	98,0 kbyte	[filförteckning]
armel	34,7 kbyte	73,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	34,0 kbyte	61,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	37,7 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
i386	37,8 kbyte	77,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	41,3 kbyte	106,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	35,9 kbyte	73,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	36,3 kbyte	100,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	37,1 kbyte	98,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	37,7 kbyte	98,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	35,9 kbyte	70,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	37,1 kbyte	78,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	38,5 kbyte	97,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	34,8 kbyte	1.060,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	37,0 kbyte	77,0 kbyte	[filförteckning]