Paket: python3-htseq (2.0.5-2 och andra)

Länkar för python3-htseq

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet htseq:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Diane Trout (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [www-huber.embl.de]

Liknande paket:

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

Andra paket besläktade med python3-htseq

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el]
dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, m68k]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC stödbibliotek
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ej x32]

GNU standardbibliotek v3 för C++

dep: libstdc++6 (>= 5) [x32]
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.13) [ej x32]

dep: python3 (<< 3.9) [x32]

dep: python3 (>= 3.11~) [ej x32]

dep: python3 (>= 3.8~) [x32]
dep: python3-numpy [x32]

Fast array facility to the Python language (Python 3)

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ej x32]
dep: python3-numpy-abi9 [ej x32]

virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Hämta python3-htseq

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	2.0.5-2	422,8 kbyte	2.164,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	2.0.5-2	478,0 kbyte	1.837,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.0.5-2	414,8 kbyte	1.836,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.0.5-2	411,7 kbyte	1.668,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.0.5-2	420,8 kbyte	1.276,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.0.5-2	475,4 kbyte	1.914,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	2.0.5-2	401,3 kbyte	1.652,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.0.5-2	378,1 kbyte	2.076,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.0.5-2	452,7 kbyte	2.156,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	2.0.5-2	471,5 kbyte	1.472,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	2.0.5-2	550,5 kbyte	1.622,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.11.3-1	268,1 kbyte	816,0 kbyte	[filförteckning]